不过，也不是每个人都能接受这一说法的，清朝文人甘熙在自己的作品中提出非议：朱元璋为了修建孝陵，从国库拨出几百万两银子，从民间征调几万民夫，用了十几年的时间，总该不是为了马皇后一个人造的吧？
况且，葬在朝天宫与礼制不符，朱允炆又是个孝顺的皇孙，就算朱元璋有遗嘱在先，朱允炆也不忍心将祖父葬在陵外。也许，朱元璋葬在孝陵和朝天宫这两种说法均不能自圆其说，后来，又有人提出：朱元璋被葬在燕京万岁山。
且看清朝诗人留下的《万岁殿》："明祖手持一杯酒，布衣刘季真吾友。煤山万寿耸峥嵘，犹是因依万岁名。"后经查证，这种说法纯属子虚乌有，没有任何证据表明朱元璋葬在燕京，可信度不高。况且，燕京就在朱棣的地盘之内，那么，朱棣的靖难理由根本站不住脚。
