除了面对如狼似虎的清军外，张献忠还得面对来自叛军的威胁。当时大西军叛将刘进忠，投降后带领清军进入四川，长驱直入，打了张献忠一个措手不及。张献忠也不是吃素的，率军奋力死战，虽然农民军因为疏忽大意损失惨重，清军同样没有占到多大便宜，战斗中，清军猛将格布库也被斩杀。
由于清军人多势众，大西军则是没有后援，张献忠也只能且战且退，撤到了西充县，退守当地的凤凰山。不久后，张献忠听到属下禀告，清军大部队来袭，他来不及穿上战甲，马上带领手下亲兵来到一处高坡观察敌情，结果一支利箭突然射来，射穿了张献忠的胸膛。史书中记载是
"直前射之，洞胸坠马"
。可怜一代枭雄，就这样结束了自己的人生，年仅四十岁。
