宋军三面受敌，全线溃退，宋太宗也被人包围在满城附近。在这危急关头，秦翰率一支骑兵绕到围城辽兵的身后，对他们发动突然袭击。此战秦翰斩敌上万，为宋太宗杀出了一条血路。宋太宗乘驴车逃出后，对秦翰大加赞赏，任命他为镇、定、高阳关三路排阵都监。
咸平四年七月，辽人南侵。秦翰与杨延朗(即杨六郎)、杨嗣、张凝等名将前去设防。十一月，杨延朗、杨嗣二人因兵力单薄被围，秦翰与李继宣驰援二杨，并于辽人展开血战。此战宋军斩首两万余级。景德元年，宋辽爆发大战。宋真宗在宰相寇准的支持下，御驾亲征。宋真宗在到达澶州后便调任秦翰为驾前西面排阵钤辖，主管大阵之事。秦翰知道将有大战，便命人马不停蹄的整修环城的防御设施。刚修好，就有人来报：辽兵南下。后来宋将张环用床子弩射杀辽军先锋萧达，辽军士气受损，与宋朝签订了"澶渊之盟"。
之后在北宋与西夏的战争中，秦翰也是战功赫赫。不仅俘虏了西夏党项族首领李继捧，而且在其镇守西北期间，西夏人也是闻风丧胆，不敢寇边。在秦翰一生中，为保家卫国负伤了49次，但却从不居功自傲。不揽权、不谋私，实属罕见。但因为当时文人对宦官抱有偏见，所以刻意压制他的战功，导致很多人不知道他的事迹。
