但是朱厚熜刚进京城，一场冲突便发生了。当时的内阁在首辅杨廷和的安排下，以太子之礼在东华门迎接朱厚熜入宫，并居于文华殿。按礼来说这并没有什么问题，因为朱厚熜是承嗣于武宗的父亲孝宗的。
也就是说他已经过继给了孝宗一脉，成为了宗法上武宗的亲弟弟。按照礼仪来说他确实是要先承太子位，再行登基大礼。但是当时的朱厚熜在见到东华门的时候，拒不入宫。直言道:遗诏中说我是承嗣帝位，不是承嗣太子位!
当时东华门前的场面十分尴尬，双方互不妥协。最后还是皇太后令群臣劝进，朱厚熜才在受笺后以皇帝之礼由大明门进，于奉天殿继位，正式登基称帝。为何会这样呢，实际上这是朱厚熜与首辅文臣集团的第一次交锋。
虽说按照礼仪来说没有错，但是当时的朱厚照已经驾崩。即使有太子，这时候也是立刻就要登基的。这时候没有比新帝登基更为重要的事情了，说白了其实就是杨廷和为主的首辅集团想要给年少的朱厚熜一个下马威。
