中日甲午战争爆发。清政府命刘永福赴台帮巡抚邵友濂办理防务。8月，刘永福率黑旗军赴台北，后又奉命驻守台南，并先后在潮汕、台湾等地招募新兵，将黑旗军扩充至八营，决心为保卫台湾血战到底。清政府战败求和，与日本签订了《马关条约》，把台湾、澎湖列岛割让日本，刘永福便率领黑旗军赴台抗日。
1917年元月9日，刘永福走完了一生的历史途程，在钦州老家溘然长逝，终年80岁。刘永福墓，位于广西钦州市钦南区沙埠镇沙寮村委老虎头村一座山岭上，刘永福墓在民国时期曾被盗过数十次，20世纪90年代中期也被盗过一次。2015年6月18日，再次发现被盗挖，墓碑区域基本坍塌，被挖开区域出现一个直径约60厘米的盗洞。
