秦叔宝先后为多方势力效过力，而且还在隋朝名将杨林和来护儿当过差。可以说得上是隋朝的旧党，再加上他先后投靠了李密和王世充等人。如果大唐再出现什么其他的叛变份子如果他放叛了大唐那又如何是好？''有苦一起尝，有福不同享''这个道理很多人都知道，所以当李世民当上皇帝以后难免会开始提防这秦叔宝生怕他造反。
再加上凌烟阁修建好的时候秦叔宝已经过世五年了，这一段时间里面大唐的人才是一批又一批地出现。所以到最后封功臣的时候，李世民也是可能一时间把他给忘记了，当封得差不多的时候才想起来的。
出于这些原因，才导致了秦叔宝在凌烟阁二十四功臣中位列最后一名。而事实上秦叔宝的名声远远比其他的二十三人大，在民间也流传这他许多的传奇故事。不管是历史上对他的评价还是他的对手或是他的朋友都对他充满了佩服。可是由于一些特殊的原因他只能委屈地位列凌烟阁二十四功臣之末尾了。
