杨光先讲，"宁可使中夏无好历法，不可使中夏有西洋人"，可见这是一个及其排外和固守传统的人。顺治十六年，杨光先指出汤若望选择荣亲王葬期不用正五行，反用洪范五行之谬。不过，因为位卑言轻，杨光先的上书被阻止。不过，杨光先是个很有毅力和恒心的人，一连告了很多年的状，都因为顺治帝对汤若望的崇信没有被理睬。
康熙年间，钦天监夏官正李祖白执笔，撰写了《天学传概》，书中驳斥了杨光先的天主教是x教的说法，并且讲明朝把天主教封为"天学"。李祖白还说，天主上帝"在中国为伏羲氏，乃中国之初人，实如德亚之苗裔"。李祖白这种睁着眼睛说瞎话，愣是把基督耶稣说成是中国人的说法自然遭到了杨光先的阻击。
杨光先控告汤若望"假以修历为名，阴行邪教，延至今日，逆谋渐张，令历官李祖白造《天学传概》妖书，谓东西万国皆是邪教之子孙，来中夏者为伏羲氏，六经四书是邪教之法语微言"。"又有邪党于济南、淮安、扬州·一"并京师，共三十堂，香山岙盈万人，踞为巢穴"，他们"内外勾连，谋为不轨"，请求朝廷早日剪除。
有名的"汤若望案"爆发，仅仅四个月后，最终的判决下来了。汤若望、李祖白、利类思、安文思、南怀仁、徐乾、潘尽孝共谋立邪教，又编造新书，蛊惑众人属实。所以，主犯汤若望，拟以立即凌迟处死。从犯李祖白、利类思、安文思、南怀仁、潘尽孝，各杖四十，流徒宁古塔。徐乾系满洲包衣，拟加枵三个月，打一百鞭 。题本批红着三法司核拟具奏 。
