11月7日，暴乱的策划人刘祥兴、杜朱衣等26人被斩首，从照片中可以看出，就算被捆着双手关在笼子里，罪犯们依旧目光坚毅。而当时行刑的刽子手面黄肌瘦，脚上连鞋都没有穿，跟我们印象中膀壮腰圆的刽子手形象相差甚远。由此可见当时百姓生活的艰辛。
除了26人被斩首之外，其他没在暴乱中牺牲的66名从犯皆被判无期徒刑，或者发配边疆充军，有的女子则被浸猪笼，而地方官员因为治理不当被革职查办。但让人惊讶的是，严惩犯人之后，英国人就没再追究这件事了，他们将遇害者的遗体安葬于福建仓山，带着遇害人家属及传教士进行了简单的吊唁。
奇怪的是，他们并未趁机攻占中国土地或者要求赔款等，这般息事宁人的操作，就连清政府都意外不已。但这件事也充分的体现了列强国家恃强凌弱的本性，也再一次向世人阐述了"弱国无外交"的道理。
