即使不站在清朝的立场，假设清朝灭亡后中国仍是由另一个封建王朝统治，对太平天国运动多半也没什么好评价，毕竟这个政权实在是太怪异了，所以即使是后朝也会对太平天国唾弃。然而清朝不是通过改朝换代结束的，而是通过革命结束的。而有意思的是：后继的民国政权对于太平天国运动的评价非常高！
民国十八年（1929年），南京国民政府就《禁止诬蔑太平天国案》，特别函请内政部、教育部参考酌办，之后正式规定：嗣后如有记述太平史实者，禁止沿用'粤贼'诸称，而代以太平军或相应之名称"，从此将"太平天国"、"太平军"等称谓写入正史。
这实际是意味着太平天国的正当性被承认了，民国政府为什么要这么干呢？当然不是出于站在工农的立场，要知道民国政府平反的农民战争也就太平天国一起。
其实，民国政府的这一做法和当时整个中国环境的思潮有关，清末民初的时候，中国国内民族主义思潮兴盛，大家将反清情绪延伸到排满，反清之时，革命党人将太平天国革命的性质认定为民族革命，宣传太平天国的民族革命传统，所以在民国建立的过程中，清末革命党人多利用太平天国来进行反满宣传。
