到是他的小儿子陈理被陈友谅的手下张定边带着逃回了武昌，随后陈理继承了陈友谅的帝位。至正二十四年，朱元璋亲征武昌，陈理不敌，于是就投降了。朱元璋也并没有杀了陈理，反而封他为"归德候"，这其实也不过是为了稳定陈友谅的旧部，防止他们反叛。几年后，陈理便被送到了高丽国，估计是朱元璋嫌他碍眼，便将他给打发走了。
传说陈友谅还有第三个儿子，是他的小妾阇氏所生的遗腹子。武昌被攻破之后，朱元璋见到陈友谅的小妾阇氏十分貌美，便将其掳走，收入后宫。不久之后阇氏就剩下了一个儿子，名为朱梓，在朱梓去封地之前，他的母亲阇氏告诉他，他是陈友谅的儿子，忍辱偷生这么多年就是为了让他为父报仇。朱梓知道真相之后便起兵造反，后被镇压，朱梓带着妻子自焚而死了。
传说朱元璋知道自己为别人养了这么多年儿子之后，非常愤怒，竟然屠城以泄私愤，以至于血流成河。但这种说法依据不可考，据正史记载，陈友谅死于1363年，而朱梓出生于1369年，所以朱梓确是朱元璋的儿子，他的死因也不是谋逆，而是受胡惟庸案的牵连，害怕的自焚而死。
朱元璋视陈友谅为劲敌，他曾说过"友谅亡，天下不难定也"，可见对陈友谅的重视。陈友谅与朱元璋棋逢对手，但终究还是陈友谅棋差一招，这天下就归了朱元璋。
