接连两次失败后，以顾宪成、高攀龙为代表的东林党人认为在大官僚、大地主掌控朝政的情况下很难将他们挤出权力中枢，所以他们就想通过全力帮助朱常洛成为太子的方式掌控朝政。
万历四十八年，明神宗驾崩，朱常洛继位，东林党当年对朱常洛的帮助终于收到了回报。在朱常洛的支持下，东林党面对齐、楚、浙等党时拥有了优势。
泰昌末期，东林党人杨涟和左光斗又帮助明熹宗摆脱了李选侍的挟持。在坐稳皇位后，明熹宗随即对东林党投桃报李，东林党终于将齐、楚、浙等党挤出了权力中枢，并全面掌控了朝政。
天启元年十二月，东林党人甄淑乘东林党掌控朝政之机提出了"摊丁入亩"的建议。这个建议要是能在东林党手中变为现实，大明的统治危机就能从根本上得到缓解，而东林党则完全可以成为大明的拯救者。
