大业十三年(617年)七月，薛举在兰州称帝，封妻子鞠氏为皇后，儿子薛仁杲为太子，尊母亲为皇太后。在其祖先墓地建置陵邑，立庙于城南，陈兵数万人，出巡扫墓，然后大飨士卒。
同年，薛举派薛仁杲围攻秦州(即天水郡，今甘肃天水);薛仁越前往剑口，攻掠河池郡(今陕西省凤县凤州镇)，被河池太守萧瑀击退。薛举又派遣部将常仲兴渡过黄河进击李轨，与李轨部将李赟战于昌松，常仲兴战败，全军陷没于李轨。薛仁杲攻克秦州，薛举便将都城从兰州迁至秦州。
617年，薛举兴兵进犯陕西，侵入唐朝的势力范围。李世民率军迎战，双方多次发生冲突摩擦。但最终的接过却是由于薛举无法击败李世民，不得不退兵。
