武则天为了皇位，确实对许多大臣痛下杀手，长孙无忌，上官仪，褚遂良等人都直接或间接死于武则天之手。那么武则天为什么放过程咬金呢?
首先：武则天对许多人都很尊敬的，例如老臣刘仁轨。刘仁轨公开劝诫武则天不要做吕后，这么明显的反调，武则天非但不恼怒，反而给予了奖励，并向刘仁轨保证自己不会（她当然不会做吕后，她要做皇帝），就因为当时她还要用刘仁轨，刘仁轨当时八十多岁了，在朝堂上有着很大的号召力。
高宗主政的时候，武则天所杀之人，或是所排挤打击的人，与高宗实际上是一致的。只不过是在后世小说家的演义之下，把贞观之后的政治斗争演义成武则天为了自己的政治野心而打击贞观旧臣。但实际的情况恐怕与此有此不同。高宗上台之后，辅助他的大臣太宗的顾命大臣长孙无忌和褚遂良为代表，他们的政治倾向肯定是延续贞观政治。
显庆三年，高宗和武则天就对关陇集团动手了。你也可以说程咬金事前得到了什么风声，躲了。但是，程咬金在打仗过程中做出屠城这种事，在高宗和武则天眼里，也只是一个莽夫吧。而且程咬金好好的干嘛屠城？也是一个令人费解的事，也许他是故意为之？从而故意获罪，躲过即将到来的对关陇集团的清洗？
