而在科学价值方面，项目简介中明确写道，其推翻了误导物理学界和人类认识世界基本方法的爱因斯坦的相对论，为科学的健康发展扫清了一个巨大障碍。此外，该项目还解决了物理学与哲学之间可能存在的矛盾；确定了意识的来源，否定了鬼神论；避免了物质命名的逻辑谬误；确立了正确的唯物主义时空质能观，为正确地认识世界和有效地改造世界奠定了基础等。
新京报贝壳财经记者注意到，上述内容包括了许多目前科学尚未解决的问题：如意识的本质以及意识的来源，甚至什么是意识现在在科学上仍没有统一的观点；光为何有波粒二象性也一直是众多科学家争论上百年的经典问题，至今依然没有完美的解释方案。
李子丰的这一项目被曝光后，立刻引发广泛争议。贝壳财经记者阅读"项目代表性论著"中李子丰所著《狭义相对论的本质及对科学哲学和社会的影响》发现，李子丰主要怀疑的理论是狭义相对论，其认为狭义相对论的错误来源于对光速不变原理的错误理解。其主要论据包括"将狭义相对论公式推导过程中的光速改为声速就会得出任何物体运动不能大于声速的结论"等。因此其认为"狭义相对论的理论基础是错误的"。
对于"声速不变"，知乎认证为"科研话题优秀答主北京科技大学工学博士在读"的零度君表示，从数学上确实可以定义声速不变，但同时也可以定义蜗牛速度不变等，随便找个速度都可以。"但是物理学是要接受实践检验的，光速不变理论目前没有反例，而超音速可是有反例的。"
此外，李子丰表示，"在时空观方面，爱因斯坦本人一生有的只是假想实验"。并在摘要中表示，其"分析了狭义相对论对科学、哲学和社会的危害。提倡发扬实事求是的唯物主义作风、百花齐放百家争鸣的出版方针，把科学研究从狭义相对论的禁锢中解放出来。抛弃唯心主义的狭义相对论的时空质能观，恢复和发展唯物主义的时空质能观"。
