等到长安城被赤眉军攻破之后，更始帝单人匹马的逃出长安，这个时候还在监狱里面的刘恭听说之后，立马步行去追赶更始帝，一直到高陵才追到。按照正常人的想法，自己的弟弟是皇帝，自己就是王爷，高兴还不行，怎么会追随已经倒台的君主。
而刘恭不是普通人，他追到更始帝之后，陪伴在更始帝左右，最后更始帝决定投降也是刘恭从中斡旋。更始帝投降后，赤眉军将领要杀更始帝，也是刘恭从中阻拦，更始帝才没有被杀，最后更是据理力争的为更始帝讨来了长沙王的封号。
虽然更始帝在刘恭的保护下暂时没死，但是还是逃不过被杀的命运，赤眉军将领谢禄最终还是把更始帝杀害。当时更始帝是在郊外被杀，刘恭知道后，大哭一场，连夜赶到郊外给更始帝收尸，并且立志为更始帝报仇。
在赤眉军掌权的三年中，刘恭没有机会，在赤眉军投降刘秀之后，赤眉军将领都被解除了军权，这个时候刘恭认为自己为主报仇的机会终于来了，于是在洛阳把谢禄刺杀，终于为旧主更始帝报了仇，刘秀也认为他忠义也没有责怪他。
按道理讲刘恭为主报仇看在谁的眼中都是值得尊敬的一件事情，但是这件事情却没被更始帝的儿子理解，当时更始帝死后留下三个儿子，并且因为更始帝和刘秀都是本家，没出五服，所以就把更始帝的三个儿子都封为列侯。
更始帝的儿子刘鲤认为自己的父亲是被刘盆子所杀，所以一直怨恨刘盆子，刘盆子他是不敢杀的，虽然刘盆子已经不是皇帝，但是被刘秀保护，所以他就把自己的目标定在了刘恭的身上。于是通过结交刘秀的二儿子刘辅，利用刘辅结交的游侠，于是在公元52年，刘恭被更始帝的儿子派人杀害。
刘恭一生对更始帝忠心耿耿，并且还帮助更始帝报仇，最终却死在了更始帝儿子的手中，可叹刘恭的一生多么的悲情。但是刘恭一生经历更始、建世、光武三个政权，也算得上是经历丰富，如果刘恭知道自己是被更始帝的儿子杀害，不知道刘恭的会是什么想法。
