君主专制层面，清朝更是集古今之大成。明代经常发生大臣与皇帝意见相左的事情，有时君臣双方争执不下，皇帝竟以暴力的廷杖强迫大臣退让。但到了清代，情况截然不同，特别是康熙以来，大臣们对皇帝愈发敬服，所谓"出一言而盈廷称圣，发一令而四海讴歌"，皇帝完全不需要廷杖这样的暴力手段，就能够让大臣们顺从臣服，更无需设置锦衣卫、东厂之流，专制主义君主集权于此真正发展到了巅峰。在后世的评述中，这样的政治生态并不健康，甚至可以说是病态的。但就集权的统治艺术而言，不能不说清朝皇帝的权术极为高明，远超明朝的帝王。
明清交替之所以如此受人重视，一个重要原因是许多人想为近代以来的屈辱史找到一个理由，是怪大明不努力？还是怪大清太落后？其实，大明也好，大清也罢，都在同一条历史轨迹之上，两个王朝的主要面相并没有太大差异，在最为关键的中央集权、君主专制等方面，更是前后继承。明清交替之中，许多社会、经济、文化领域的变动，对整个帝国的前途走向而言，只是历史的支流，远没能达到改变国势的地步。在中华帝国的这条历史主线上，明清易代的变革造成了前后往复的动荡，但并没有改变方向。
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