公元26年，由于受到刘玄残部以及关中豪强的夹击，长安粮草断绝，樊崇为了摆脱困境，于同年12月被迫撤出长安。公元27年，赤眉军被冯异及刘秀的大军双面夹击，樊崇及手下大将被杀，赤眉军最终被刘秀所灭。建世帝刘盆子只能向刘秀投降，赤眉汉退出历史舞台。
赤眉汉从公元25年建立至27年灭亡，存在时间与玄汉差不多。为什么沉重打击新朝，并一举灭亡玄汉的赤眉汉短短三年即消失在历史长河中？小编认为主要原因有以下几个：
一、 农民阶级的劣根性是造成赤眉汉败亡的主要原因
赤眉军主要成分是流民，刘盆子被选为皇帝不是因为刘盆子能力强，而是赤眉军抽签抽中了他。赤眉军领导层的决策水平可见一斑。
赤眉军和绿林军一样都是为了生存而被迫起义的，他们以满足自身需求为最终目的，一旦建立政权即开始享乐，没有考虑如何发展和持续生存的问题。
