再后来清军来打京师，永平四关失守，朝廷恐慌，需要四方部将勤王。但是这些部将个个自顾不暇，哪里舍得拿出兵力来勤王？可是秦良玉一根筋，打定主意要勤王保护京师，还把家里的钱拿出来当军饷。秦良玉带兵入京，把崇祯皇帝感动得要命，当时就赋诗四首来赞颂秦良玉。
张献忠攻打川东，秦良玉知道了立马率军过去攻打张献忠。张献忠听说过秦良玉彪悍的名声，当时就吓得赶紧走了。后来秦良玉和儿子前后夹击，把张献忠打的夹着尾巴逃走。张献忠接受了朝廷的招安后，又和罗汝才作乱。秦良玉再去攻打罗汝才和张献忠，可惜因为和其他前来平乱的将领想法发生分歧， 未能成功平乱。
张献忠再次进犯重庆，秦良玉率兵前去，因为寡不敌众，秦良玉败给张献忠。张献忠开始在四川作乱，可是忌惮秦良玉的勇猛，独独不敢来秦良玉驻守的石砫。清军入关后，秦良玉拒绝投降，七十五岁时在石砫去世，死后被追封为忠贞侯。秦良玉就是那个被单独记载到将相列传里的女英雄，被后世传颂褒扬的爱国名将。
