后来有个名叫张差的人，手持木棍闯入太子的寝宫，将门口的太监打伤后，便直接进入。幸好太监韩本用及时发现，将其生擒。案件审查过程中，张差一口咬定，自己收了郑贵妃手下太监庞保、刘成的钱，才去杀太子的。在说供词的过程中，张差语无伦次，前言不搭后语，似乎精神有问题。
如果此案继续审问，必定会牵连一大批人。于是，万历帝下令将张差以疯癫奸徒罪处死，并秘密地杀死庞保、刘成二人，草草地了结了"梃击案"。
《三朝要典》中，魏忠贤便引用了"梃击案"，但事情的经过，他却用颠倒黑白的方式，好人变坏人的方式，重新讲述一遍。"梃击案"的祸首是何士晋（东林党人），他利用非常手段查出实情，比如捏造实情真相，用来敲诈无辜之人。虽然案件被侦破，但他却得罪万历皇帝，因此被削掉官职。
