建文四年，灵璧战败，猛将平安等被捉。盛庸独自率军驻扎在淮水南岸，燕将丘福偷偷渡过淮河，出现在盛庸军后，盛庸退守长江。燕兵渡过淮水，由盱眙攻陷扬州，盛庸在六合及浦子口率军抵御，都失利，都督陈蠧率水师投降燕军，燕兵乘势渡江，盛庸仓促聚集海船出高资港迎战，又败。
燕王朱棣攻入南京后，自立为帝，盛庸率余部投降，随即奉命驻守淮安，看住还死守在山东的昔日战友铁铉。铁铉被抓住凌迟后，朱棣给盛庸下了一道谕旨说："以前山东未定，所以才命你镇守淮安。现在铁铉被俘，诸郡全部平定。朕念山东久为兵乱所困，疲于转输之劳。你应当抚兵养民，这样才符合我的心意。"
盛庸接到朱棣的敕书，仔细琢磨了好久，明白了朱棣的意思，于是递上辞呈，告老还乡，朱棣龙颜大悦，马上予以批准，此时是永乐元年春夏之际。
