消灭嫪毐后，因为嫪毐是吕不韦推荐的人，秦始皇抓住机会下手对付相国吕不韦。 不过由于嫪毐的"叛乱"是由吕不韦告诉嬴政，才让其有所准备，并最终将嫪毐制服，吕不韦在此事上有弥补之功。
嬴政念吕不韦多年来对秦国有功和告发嫪毐的叛乱计划，免了吕不韦的死刑，只是把他发配到洛阳，让他在家里老死。
吕不韦先后辅佐了秦国两代君王，劳苦功高，且高居相国之位，并代秦始皇嬴政行使最高权力十余年之久，在天下间声望还是很高的。 所以吕不韦被秦始皇遣送到洛阳后，非但没有就此沉静下去，反而引得各国使臣前来拜会，就连朝中大臣也来汇报国家大事，再加上他还控制着秦国的财团，这也就等于控制了秦国的经济命脉。
据历史上记载来看，让吕不韦饮鸠自尽的直接原因便是秦始皇亲自写给他的这封"君何功于秦"的信，在这封信中，虽然最后只是让吕不韦迁往蜀地居住，但信中秦始皇的几句严厉的反问等于全盘否定了吕不韦对自己父子两人的功勋，态度非常不友好，寥寥几句透露出一种想除掉吕不韦的意思。
智慧精明的吕不韦又怎会不明圣意，他担心会遭到身死族灭的下场，于是为了保全自己的家族，吕不韦经过一番权衡利弊之后，决定采用最小的代价-自杀，来取得了自己利益最大化，即保全整个家族。 这正印证了古人的一句话：君叫臣死，臣不得不死。君命难违，道不尽的是为人臣的辛酸与无奈。
