清军在打压太平军的过程中极爱屠城，其中尤以湘军为罪。湘军的屠城记载主要有三次，分别是九江城屠二万、安庆屠四万人、南京屠五十万人，场面惨不忍睹。为此，谭嗣同极为愤概地说":湘军以戮民为义，（城邑）一经湘军之所谓克复，借搜缉捕匪为名，无良秀皆膏之于锋刃，乘势淫掳焚掠，无所不至，卷东南数省之精髓，悉数入于湘军，或至逾三四十年，无能恢复其元气……"
太平军也有过屠城的记载。全州被攻破时，冯云山战死，一心想要报仇的杨秀清下达了屠城的命令，屠城持续三日，被杀者数万人；太平军北伐时，沧州遭遇屠城，万余百姓被杀害。此外，在个人笔记中也有太平军屠杀乡民的记载。
