1630年，金军攻入关内，兵临城下之际，崇祯紧急调兵，秦良玉火速北上增援，在将后金打退后，秦良玉呗崇祯召见，庆功宴上，崇祯多次表扬秦良玉的功劳，1639年张献忠在连破朝廷军于观音岩和三皇岭后，秦良玉过去救人，却被张献忠打败，属下三万人死伤殆尽，1643年，张献忠打到了夔州，秦良玉急忙赶往支援，却因为兵力不足，再次被击溃，至死所有蜀地被张献忠占领，秦良玉曾说：我兄弟二人都已为国捐躯，我一介妇人身受国恩二十年，现在不幸到了这个地步，又怎敢在晚年去侍奉逆贼？随后，他表示凡是有投靠敌人的，一律灭族，最后，张献忠失败，被秦良玉给打败了，不得不退兵到湖广一代。
1646年，秦良玉被南明隆武政权赐封太子太保、忠贞侯封号，这是我国正史上唯一一次记载的以战功封侯的女将军。两年后，这个传奇女将在75岁的时候结束了她悲壮的一生。
据说，秦良玉死后，连发了48道桑，修了四十八座坟墓，而这四十八座坟墓只有一座是在秦良玉出生的忠县，其余的都在石柱县，在葬礼当天，要求所有人在有限时间必须赶回来，否则会被当场处死，由于48支队伍都担心不能及时返回，于是一路着急忙慌的赶了回来，累的要死要活，在吃饭的时候，没想到饭菜里被下毒，所有的送葬人员都被毒死，而秦良玉到底在哪个陵墓也没人知道了。
