三部勾院在北宋初期和中期在防止贪污腐败和防止偷税漏税方面起到了重大作用。但是宋朝的统治者对权力的制衡很敏感，在宋太祖将三部勾院一分为三后，又重新将之合三为二。之后更是在宋太宗时期，赵光义为了提高审计部门的工作效率，又重新将他们合并成了一个机构成为勾院。
在之后的宋朝皇帝们，对待勾院更是不断的进行调整，三部勾院在60年内来来回回分合了将近十多次。这也表现了宋朝皇帝，在对待国家审计部门的高度重视和理解上的不成熟。
但是在北宋中期，国家政治风气慢慢走向了腐败，在三司之下的审计部门勾院越来越难以发挥到他本来的作用。宋仁宗时期的著名史学家范镇就曾说过，在国家困顿，财产不足的时候，枢密院依旧冗兵严重，三司依旧到处敛财，体现了当时社会贪污腐败严重，而"三冗两积"的问题也开始在北宋出现。
