令后世不理解的是，朱元璋的四儿子，也就是后来的朱棣大帝，是众多的儿子们中和朱元璋性格最像，手段也是很相似的，但是朱元璋却放弃了培养这样一个继承人，反而去培养一个还没长大的黄头毛小子，这件事也引起了各位大臣的不满，但是既然皇帝也做出了决定他们也无力更改了。朱允炆的性格温和，朱元璋担心自己死后几个儿子尤其是朱棣会对朱允炆不利，于是下了一道圣旨，在自己死后不允许任何藩王回京吊唁。
在朱元璋最后的几天了虽然已经神志不清但还是放心不下，不停地问身边的仆人："燕王来否"（燕王就是朱棣），但是这时候朱允炆已经买通了朱元璋身边的人不让他们告诉朱元璋那些叔父的下落。其实朱允炆一直会错了意，朱元璋不太可能在临死前突然改变太子的人选，他在临死前一直念叨"燕王来否"可能是在担心朱允炆的处境，当然这些都是后世的猜测，至于朱元璋生前几天为什么记挂朱棣，这就不得而知了。
