到了雍正皇帝，又再一次把内阁大学士的权力削弱，雍正七年（公元1729年），雍正皇帝设立军需房，后来改成大家都非常熟悉的"军机处"。这个时候保和殿大学士是清朝官员中，最高的官职。
到了乾隆时期，对军机处进行了改动，军机大臣和军机章京，都是兼职，它们又有了一种新名词"军机处行走"、"军机处大臣上行走"，刚到军机处上任的叫"在军机大臣上学习行走"，经过一段时间历练以后，可以把"学习"去掉。
军机处又分为大军机处和小军机处，在军机处任职的官员称为军机大臣，也就是所谓的大军机处；军机大臣的幕僚，比如皇帝从满、汉大学士及各部、院、寺长官中挑选人才，当军机大臣的幕僚，这些人称为小军机处。
