此时的察哈尔部首领是库登汗，是俺答汗的堂侄，其人并无雄才大略。而同时的俺答汗并不满足于统一蒙古右翼，他想要重新一统整个蒙古地区，察哈尔部自然也成了他的目标。
为了防止被俺答汗吞并，察哈尔部和部分喀尔喀部在库登汗的率领下南迁，移牧于大兴安岭东南半部，即从辽西到吉林一带沿长城外的地域。史称"左翼蒙古南迁"。
左翼蒙古的南迁，对蒙古、大明及其后来兴起的后金都影响深远。对于蒙古人来说，左翼的喀尔喀万户原本由12个鄂托克组成，原本就游牧于今天的外蒙古，而当库登汗的使者号召他们一起南迁，喀尔喀部分成了两派：
内喀尔喀，在东北的建州女真崛起之后，逐渐被努尔哈赤所吞并；
