结果最后查来查去，查到了朱檀和汤氏身上，因为这事已经闹了挺大的动静，不少人也已经猜到了和朱檀有关，所以朱元璋必须给个说法。虽然朱元璋愤怒地看着朱檀，也是恨铁不成钢，可是毕竟是自己的儿子。这时丞相李善长向朱元璋提议，反正朱檀头发也快掉没了，还不如趁机施行髡刑，以如此有严厉的刑罚替代死刑，也还能留他一条命。
最后朱元璋就下令对朱檀施以髡刑，而朱檀的妻子汤氏以及那些炼丹的方士则没有那么好的待遇了，被凌迟处死。可是这个朱檀虽然接受了髡刑却也没活多久，大概是食用大量丹药所致，19岁就身亡了。
在朱元璋的所有孩子中，对朱檀实行的这个髡刑是最严厉的刑罚了，他之所以这么做，一个很重要的原因就是避免失掉民心。毕竟天子犯法与庶民同罪，作为一个穷苦百姓出身的皇帝，他十分清楚民心的重要性，这也是朱元璋治国的一种手段。
