可他并不满足于此，他开始了逼宫，逼迫皇太后废掉当时的皇帝司马奕，理由是所谓的不能生育。然后扶持了司马昱做傀儡皇帝，那些反对他的政敌也逐渐被除去，桓温的权力一日比一日大，就连皇族司马家也被他玩弄于鼓掌之中。
傀儡皇帝司马昱死后，桓温就带着军队去拜皇陵，传言他要灭了王家和谢家，弄得朝堂动荡，鸡犬不宁。不过没想到，这期间桓温病死了，很多人松了一口气，以为事情过去了。
没想到他的儿子桓玄更胜一筹，他直接推翻了晋国，让皇帝退位，自己做了皇帝，改了国号为楚，这个时候距离当时司马懿杀掉皇家正好是150年，这种结果大概司马懿也想不到吧，或许这就是因果循环吧。
