《明史》没有提到诛十族，但在细节描述上比前四版更详细，绘声绘色，"天下读书种子绝矣"，以及方孝孺与朱棣的对话（比第四版更详细），矛盾的升级，朱棣的虚伪，恼羞成怒之下的残暴，一一表现的淋漓尽致，将野史内容升级为正史了。问题在于，离那一段历史最近的前两版，《明史》不采用，却采用后面离谱的野史版本，这是典型的篡改历史。
尤其注意的是，《明史》号称精雕细琢，编修了百余年，但最终却像写小说一样写这段历史，源头却还是出自野史，这就不能不说清朝为了抹黑朱棣、篡改历史，也的确是下了一番功夫。其实，近代以来，随着清王朝的灭亡，很多不利于清朝的文献资料公开之后，《明史》记载已被多次推翻，这不过又一次罢了。
对比这五版记载，朱棣主要有三宗罪：一是"诛十族"，二是"杀了天下读书种子"，三是朱棣与方孝孺的一段对话，朱棣自称效仿周公，此后方孝孺让他立朱允炆之弟或之子为帝，却遭到朱棣反对，由此揭开了朱棣虚伪内心。
但，从朱棣与方孝孺事迹演变来看，这三宗罪都是虚构，根本就是子虚乌有。笔者看来，第二版最为合理，最接近历史真相，其他版本存在明显的添油加醋，足以可以证明是虚构。因为方孝孺文坛政坛的影响力，最好由他拟定诏书，但方孝孺不肯拟诏，加上当初江南文人对朱棣的谩骂，一气之下朱棣将他夷族，这是最可能的真相。
另外关于诛十族，明清浙江的《宁海县志》记载"明朝万历年间，万历下诏为方孝孺平反，并赐给祭田，将孝孺公次子中宪后人从松江府华亭县寻回，世居浙江宁海至今。该支系以克勤公（孝孺父）为一世祖，传今约25世，后裔约500人。"都被诛十族了，方孝孺次子竟然还有一大堆后人，显然诛十族不攻自破。而且，还有很多文献，以及如今还活生生的数万方孝孺后人，直接戳穿了诛十族的谎言。
