石达开毕竟是翼王，对于太平军的虚实还是了然于心的，也对当下形势十分清楚。所以，虽然和天王有些隔阂，但并未完全与之决裂，他在出走时并未带走多少太平军，陈玉成、李秀成等都还驻扎在原地。
石达开后来率兵直取江西，企图在创出另一番事业来。后来他连克浙江多座城镇，清朝担心其雄踞浙江全境，于是急调曾国藩增援浙江。眼看浙江并非久留之地，他便分兵退玩江西、福建等地，却在途中遭受清军重创。于是他数度率兵北上，打算度过长江直取四川，效仿东汉末年的三家平分天下的格局。
最终却落了个兵败大渡河的惨痛下场。兵败后的石达开慷慨赴死，与自己的大儿子和一众忠心的将领，一道惨死在清军的兵刃之下。但历史上石达开投降的详细过程一直都是个谜团，直到近代才被专家王尧礼找出一惊人的答案。
因为，他在研究的过程中，找到了清朝著名学者黄彭年的书信。从这一段手迹中我们得知，石达开的兵败在于一个"异族"，彝族土司王应元及其彝族部下的围攻，在石达开退兵的过程中，遭受到占据有利地形的彝族士兵，用火石檑木对太平军进行大规模杀伤。
