当一个朝代灭亡之后，原来有重兵把守的历代皇帝陵墓也就无人看管了，因此很容易遭到盗掘。而朱元璋的陵墓在建成之后的600年内一直无人敢盗，虽然民间流传着乾隆皇帝"假修真盗"明十三陵的传说，但是这种说法并没有得到史学家的认可。并且，朱元璋明孝陵的献殿虽然遭到损毁和破坏，但是地宫却一直安然无恙。而且，根据考古专家们的探测，就算有盗墓贼敢打明孝陵地宫的主意，恐怕连地宫的位置都找不到。
在民间传说中，当年朱元璋为了防止自己的陵墓被盗，在出殡时一共安排了13个城门都同时出棺。朱元璋这样的安排，实际上就是为了迷惑以后的盗墓贼，令对方无法找到自己的陵墓之所在。实际上，朱元璋的陵墓确实另有玄机，考古专家曾经用最先进的技术对明孝陵地宫进行探测，果然有大发现。
1998年的时候，南京的文物保护部门组织专家对明孝陵进行了一次十分详细的探查。这次探查的主要目的，就是要弄清楚明孝陵地宫的现状，看看明孝陵的地宫是否遭到破坏或者盗掘。为了完成这次探查任务，专家采用了一种最新的物探技术对明孝陵地宫进行探测。这种物探技术，当初也曾用在秦始皇陵的探测任务中。
专家们经过探测后发现，明孝陵的地宫保存十分完好，也并没有被盗的痕迹。而且，更令专家们感到惊奇的是，明孝陵的地宫并不在陵墓中轴线上，这是一个十分重大的发现。
