公元1368年，朱元璋于南京称帝，国号大明，年号洪武。 同年八月，明军进逼北京，元顺帝带领三宫后妃、皇太子等弃城而走，全部逃往蒙古草原，一举结束了蒙古在中原九十八年的统治 。
所以从承续关系上来说，明朝是在推翻元朝的统治后，在此基础上建立起来的新王朝。虽然当时在中国本土的元朝廷被推翻了，但当年成吉思汗的铁骑横跨欧亚大陆，他当时所建立的"四大汗国"仍有三个存在。
这些大量曾在元朝任职的蒙古族、回族官员，流亡到中亚、西亚各国，他们逃到那里后，拼命地鼓动所在国君主对明朝采取敌视态度。
1370年，西察合台汗国权臣帖木儿发动政变，推翻西察合台汗国，建立了赫赫有名的"帖木儿帝国"。
