可惜的是事与愿违，这位从小养在深宫的王爷，就藩伊始便开始肆意妄为，强抢民女、侵吞财帛，殴打地方官员，无恶不作。这也让地方民怨四起，弹劾书信纷纷。朱元璋无奈之下，只得将朱守谦召回责备，但即便如此朱守谦还是置若罔闻，甚至对于叔叔的责备还特意作诗歌讥讽。
这也终于让朱元璋忍无可忍，将他废除爵位，幽禁凤阳。在凤阳的七年幽禁生活中，这位王爷安贫乐道，宛若改过自新。这时朱元璋又生了怜爱之心，毕竟打断骨头连着筋，遂又将朱守谦改封云南，令他前往云南就藩。但这位侄孙，可决然不是什么省油得灯，在云南比之在桂林时，不法之行径有过之而无不及，甚至还造成了少数民族的矛盾，弹劾书信再度呈送朱元璋案牍。
再次面对弹劾奏疏，这一次，朱元璋死心了。将朱守谦再度安置于凤阳老家，但即便如此朱守谦在凤阳还是不改蛮横不法，朱元璋在鞭笞一顿后，只得选择将他禁锢，1392年，才32岁朱守谦去世，对朱家同宗向来舍得的朱元璋，这一次连个谥号也没有给他。
