至正二十一年三月，朱元璋为加强统治地位对内部军事结构做出重大改革，"改枢密院为大都督府"，任命朱文正为大都督，"节制中外诸军事"，同时将功勋旧将邵荣、徐达、常遇春调往中书省，此时的朱文正事实上已经成为朱元璋麾下的最高军事统帅。
获得晋升的朱文正再次不负众望，将朱元璋从战略失误中挽救回来，这便是连后世史书都根本无法篡改的"洪都之战"，而此战也是朱文正短暂生涯中最为光彩的一战。
至正二十三年二月，张士诚遣部将吕珍突袭韩宋政权根据地安丰。此时的韩宋政权因三路北伐元廷失利，已经陷入极为窘迫之时，遭到元廷和张士诚夹击后根本无力抵抗，势穷之下迅速向朱元璋求救。
朱元璋谋臣刘基等人均劝阻其不要前行，安心解决争霸路途中最大的威胁--陈友谅，但朱元璋并未听从，以"安丰破则士诚益强"为由竟于当年三月率领徐达、常遇春等主力救援韩宋政权。
而此时的陈友谅为了重新占据优势，率领百官家属倾国之兵、号称六十余万的马步舟师直扑朱元璋而来。陈友谅大本营武昌与应天府之间最为关键的城市便是洪都（今南昌），陈友谅又因消息闭塞不知应天府内军力空虚，所以首战之地便在洪都爆发。
