从石达开返回安庆开始，之后的两年时间内相继转战江西、浙江、湖南、广西、湖北等地。虽然没有重大斩获，却也使得太平天国外部军事压力得到了部分缓解。即便如此，石达开与洪秀全之间的信任已经荡然无存。石达开为了保存自身，同时也为了能为太平天国打开局面，开始转战云贵川，试图建立新的根据地。
三、奔走西南
石达开集合了熟路人马，先后三次准备进入四川占领成都，都以失败告终。一八六二年九月再次集合诸军，制定了分兵三路奇袭成都的计划，从川南出发，开始了石达开第四次入川行动，也是最后一次。
一八六三年四月，石达开在部将李福猷的掩护下渡过金沙江，但也使得分兵熟路的计划变成了各自为战，再也无法相互产生实际支援和战略策应，石达开本部此时约有三四万众。五月三日石达开部在安宁河设伏，一举歼灭数千敌军。
