天王洪秀全密令韦、石二人率部回京共同对付杨秀清，原本是准备玩弄制衡之术，在几个实权人物中重新创造平衡。韦昌辉接到密令后迅速率部返回并包围了东王府，进而诛杀了杨秀清及其全家老幼。更趁机掌握大权，俨然成为了天京城的新主人。为了进一步清除东王一党，更是大开杀戒，激发了天京全体军民的愤慨。
石达开原本也回到了天京，后惧怕被韦昌辉一同诛杀只身逃往安庆，全家也被韦昌辉所害。于是洪、石二人内外联合，一举清除了韦昌辉及其党羽二百余人。石达开率军返回天京并被委任掌管政务，轰动整个天平天国的"天京事变"似乎已经落幕了。
二、四方转战
看似得到稳定局面仅仅维持了半年。洪秀全对石达开大权独揽的状况十分畏惧，为防止石达开成为新的杨秀清、韦昌辉，将自己的两个封王秉政，借以牵制、制衡石达开。石达开对这种局面也十分畏惧，预感到洪秀全可能会对自己动手，借整顿军务、指挥前线的机会离开了天京。从此再也没有回到过这座太平天国的都城。
