这十三位皇帝分别是：明成祖、明仁宗、明宣宗、明英宗、明宪宗、明孝宗、明武宗、明世宗、明穆宗、明神宗、明光宗、明熹宗、明思宗
未埋在明十三陵的三个皇帝是：明太祖朱元璋，明惠宗朱允炆以及明代宗朱祁钰。
明十三陵由明成祖建造，是迁都北京后开始建造的。明太祖朱元璋和明惠宗朱允炆都是在明成祖之前，那时候的首都还是南京，他们的陵墓自然没有进入明十三陵。
明朝在明太祖时期，定都南京，所以明太祖和明惠宗的陵墓也自然修建在南京。明太祖的陵墓位于南京紫金山南麓，在独龙阜玩珠峰下，东邻神州中泰中山陵，南邻梅花山，是中国最大的皇家陵墓之一。
