首先是汗位之争，忽必烈与阿里不哥的汗位之争，虽然最后忽必烈胜出，但导致了蒙古的四分五裂。
当时的蒙古各大汗国中，钦察汗国、察合台汗国、窝阔台汗国都支持阿里不哥，唯有伊尔汗国支持忽必烈。阿里不哥失败后各大汗国纷纷独立。蒙古虽打下了巨大的土地面积，却没有了统一的政权。而且忽必烈胜出后，囚禁了自己的亲弟弟阿里不哥，最后更是毒杀了这个政敌。
成吉思汗统一了蒙古各族，忽必烈虽然赢得了最后的胜利，但是他却造成了各部落分裂，所以在蒙古人的心中，忽必烈就是一个分裂的小人，没有他，蒙古还会继续辉煌。
其次是忽必烈的汉化思想，忽必烈主要生活在漠南一代，他本人非常喜欢汉文化，执政理念也是崇尚和学习汉人的执政方法。而阿里不哥则不然，他生活在漠北，骨子里继承了成吉思汗的游牧思想，因此得到了大多数蒙古人的支持。
