迁台以书画、细软居多
抗战胜利后，国民政府还都南京，分散在四川境内三地的文物被集中到了重庆。院方为感谢四川人民对文物保护所做的努力，在成都中正公园举办了一次"北平故宫博物院在蓉书画展览会"。展览的作品包含从晋朝到清代一千五百多年中八十八位画家的一百幅作品，几乎是南迁书画文物中最重要家底。为了协办展出，市政府想尽办法保障安全，除了军警还请川地的袍哥组织予以协助。
受场地局限，一百多幅书画珍品一次性展出有点困难，院方决定分为两次，每旬换一次，共历时二十多天，接待来自川内和西南各地的参观者数以万计，堪称八年抗战文化史上的一大盛况。遗憾的是展览成为这批国宝最后一次在中国大陆的亮相。
1947年，这批文物由重庆向家坡运往南京朝天宫的故宫博物院分院，后被秘密运往中国台湾。国民政府还下令当时的故宫博物院院长马衡将其余故宫文物运往南京，再和南京分院的文物一起运往中国台湾。经马衡多方周旋和拖延，此计划搁浅，北平文物得以保留在中国大陆。最终运台文物数量相当于整个南迁文物的四分之一，未来得及运走的文物原地未动，仍留在南京朝天宫。
1949年4月，迁台文物登记造册，统计文物总数为231910件又27张692页。国民政府两院理事会延续了故宫博物院的点查制度，先后出版《中华文物集成》《故宫书画录》 《故宫名画300种》等著录。1962年，台北故宫博物院在台北近郊双溪建成，定名为中山博物院。至今已五次扩建。1989年至1991年，台北故宫博物院院藏文物清点计划研究小组成立，开始对文物全面清点，1991年完成时，对外发布数字为：历代文物总数645784件（后有又多方捐赠扩充）。
