1938年6月，宪警两次闯进故宫博物院太庙图书馆搬走撕毁大批图书资料，书籍242种，340册，杂志369种，10682册。书籍中有反日抗日、谈及日伪政权和满洲的一律销毁，包括大量印有国民党青天白日标志的图书，另外含有共产主义、马克思主义等内容的绝对销毁；有关司法、教育、财政等的书籍杂志也必须销毁。这次查没销毁对故宫文献资料库藏是一个巨大打击，日本希望借助这种方式推行奴化教育。
不久的献铜运动再次把故宫博物院拖入泥潭。1945年3月，侵华日军北京陆军联络部致函伪北京特别市市长，要求"北京特别市官民"，"献纳（供出）各自存有之一切铜类，以资直接增强战力，藉以实现大东亚共荣圈之确立。"各家各户和单位被强行征收铜铁，作为日军造炮弹和子弹使用。"这个运动波及到千家万户，故宫这样的文化机关也没有幸免。"
尽管多次抵制，最终为确保故宫整体安全起见，不得不将一些散落于各院落无号的铜缸铜炮等1095斤交了出去。但金品献纳委员会和日军对此量均不满意，要求故宫必须捐献更多，因为仅北京一市日本军部下的铜铁征集任务就高达40万公斤。日伪华北政务委员会最终命令将不能断明年代的铜缸54件以及2尊铜炮运走检送。
在此之前的1944年6月22日，日军已经从故宫劫走铜灯亭91个，铜炮一尊。这批文物刚运到天津，还未及转运到日本，日军即宣告投降。张庭济等会同教育部清理战时文物损失委员会平津区助理代表王世襄，前往天津接收运回这批文物，看到的情形是"有的已残破、毁坏，共重4460公斤，较劫走时少了971公斤，而此前被劫走的 54 个铜缸也不见踪影。"根据故宫博物院院长马衡的统计，"本院（沦陷期间）被征用之铜品2095市斤外，计铜缸66口，铜炮一尊，铜灯亭91件。"
八年抗战中，北平故宫文物被日本掠夺了铜器149件，太庙图书馆大批图书杂志遭破坏，文献馆的张鼓峰舆图被劫走。
