不久，山东巡抚尹应元数列了陈增二十条背旨虐民的罪状。神宗反而大怒，痛责尹应元，说他沽名钓誉，并削去宗尧官籍，夺敖敬俸禄一年，同时还夺去尹应元的俸禄。陈增反过来却诬劾吴宗尧阻挠矿务，且令程守训蓄意捏造了许多莫须有的罪状，神宗听信谗言，下圣旨逮捕吴宗尧入诏狱。当差役和太监内侍赶到益都时，人民群起而攻之，并想杀死陈增以解心头之恨。吴宗尧临行时，向北方长叹一声，接着老泪禁不住地流了下来。吴宗尧被关押多年，几乎惨死狱中。陈增借机扩大同案，打击报复那些不买自己账的官员，因此青州府的一些官员以及商人吴时奉等均受牵连，陈增还提出要把他们的家全部抄没。
面对仗着皇威而横行无法的陈增，有的地方官吏为了保住自己的乌纱帽去奉迎他或敢怒而不敢言，有的人还狐假虎威勒索百姓，但是民变的不断爆发，农工商业的萧条凋敝，官民的满天怨气等等交织在一起，都是国家的不祥之兆。有些有识之士不禁痛心疾首，为了大明的江山社稷，为了黎民百姓的生计，他们挺身而出，呼吁撒回矿监税使，上奏其种种不法行为，并寻找巧妙的对策。
凤阳巡抚李三才为了压制那些无恶不作的陈增爪牙，暗地里组织了一批犯有死罪的囚徒，成立秘密侦察敢死队，化装乔扮成农民、商人等，几十人一股，到矿监税使出没的地方，伺机捕杀，陈增因此死去了几个得力的爪牙。程守训虽然猖狂，但畏惧李三才而不敢到淮。同时李三才想着怎样才能除掉罪大恶极的陈增和程守训。
