在井冈山斗争时期，主席经常给大家讲述游击战争思想，令寻淮洲受益匪浅，在战斗中将理论与实际相结合，灵活运动，每次都能取得非常不多的战果。
1929年，红四军开辟中央革命根据地后，寻淮洲跟随部队转战南北，先后参加三战闽西、九攻吉安的战斗。1930年初闽西地方武装整编为红12军，寻淮洲被派到红12军第34师当100团团长。
当年秋，蒋介石调集十万兵力开始第一次“围剿”苏区，当时总前委运用“撒开双手，诱敌深入”的作战方针，全歼张辉瓒部，整整消灭敌军一个师。此次战斗中，寻淮洲的100团担任左翼主攻，红军能够粉碎第一次“围剿”，寻淮洲居功至伟，战后他也被提拔为红12军第35师师长，此时他只有18岁。
1932年7月，第四次反“围剿"斗争打响了。当时寻淮洲率领红35师从福建回师赣南，与红三军团汇合后，开始向敌军出击。相继参加了乐安、宜黄战役，他仅凭一个师的兵力，就牵制住敌军几个师，有力的配合第四次反”围剿“斗争。
鉴于红35师的出色表现，全师受到军委的嘉奖，而师长寻淮洲还荣获二级列宁勋章。因为战局的发展变化，军委决定将寻淮洲调到红三军团担任红五师师长。
