祠堂里曾居住着120多户居民，产权分属十多家单位，这些单位又租赁、转租房屋，难以统一保护。李鸿章祠堂的内屋曾发生大火，幸亏消防部门及时扑灭。这座迄今已100余年、被列为市重点文物保护单位的古建筑才得以保全。
李鸿章祠堂过去的安全隐患很严重，画梁雕栋的木柱东倒西歪，有些砖块竟然已经松动，数百平方米的大照壁墙面斑驳，白色墙粉已经大面积脱落，露出青砖，三块"此墙危险，行人注意"的牌子起着警示作用。
大照壁顶部青砖小瓦在风雨中，已开始脱落，形成一个一米长的缺口，并露出木质"筋骨"。与厢房相隔5米处，是一幢破烂不堪的平房。透过玻璃窗，整个房顶几乎全部坍塌下来，画栋雕梁的木柱横七竖八倒在废墟里，但上面的花纹做工非常精细。如今残余的祠堂建筑已面目全非，但从围墙中的大小两个照壁和几进房屋的间距还能让人想象出当年这片建筑的宏伟。
南京民间曾有"北有李公祠堂，南有李公家小姐楼"。而李鸿章女儿的闺房，就在白下路的江苏省海事职业技术学院内，可见当时李家规模之大。
