更为严重的是，这些为大明建国流够了血的“淮西勋臣”，明朝开国后没几年，就成了新生大明王朝的毒瘤。由于这些人各个掌握着肥沃的土地，享受着强大的特权，于是也越发肆无忌惮，破坏国家法度乃至腐化堕落，几乎都成了常事。特别是“腐化”，那更成了流行风气，这群人治国无能，收受贿赂乃至“享乐废法”，几乎样样都不用教。倘若由着这些人闹腾下去，初建的大明王朝，百分百要走上诸多“农民起义政权”短命的老路。
所以，对于明太祖朱元璋来说，这群他曾盼着“一起慢慢变老”的“淮西勋臣”们，早就变成了一群必须恶整的人。洪武十三年的“胡惟庸大案”，别看株连极多，其实也只是开始。身在其中的李善长，自然也是朱元璋的“目标”之一。但对于李善长，这事儿却还是不一样。
在“淮西勋臣”里，李善长是个核心人物。他虽然不似徐达汤和等人手握重兵。但明朝开国战争里，他其实就是“朱元璋团队”的“管家婆”，干的就是苦活累活，根子也扎得极深。而比起汉朝的萧何来，同样有着“萧何”美名的他，权力欲却更重。以《明史》的形容说“外宽和，内多忮刻。”典型外宽内忌的角色，大明第一智囊刘基的晚年悲剧，虽是胡惟庸亲手制造，但刘基的失宠与获罪，也同样有李善长一次次推波助澜。
而且在“淮西勋臣”内部，虽然李善长早在洪武四年就早早隐退，但后来呼风唤雨的胡惟庸，最初只是宁国县一个小小的知县，就是李善长一手提拔起来。李善长的侄孙李佑，又做了胡惟庸的侄女婿，俩家正是“亲上加亲”。如此亲密关系，也令李善长在胡惟庸倒台后，惹来一阵阵喊杀声，却被当时的朱元璋硬生生摁下去。
为什么这时朱元璋不“动”李善长？一是以《明实录》的说法，朱元璋念旧情，不忍心“动”。李善长与“半路蹿红”的胡惟庸不同，和后来被杀的蓝玉更不同，这是在朱元璋“创业”早期就跟随他的老臣子，多少次为他排忧解难。“旧情”当然极深。更重要的是“不能动”，如前文所说，李善长是一个擅长“退到背后做文章”的人，自己退休前就能“捧”起胡惟庸，对刘基也能“放暗箭”，这样一个树大根深的人，当然轻易动不得。
