不久，杨牡丹入居宫闱，在武皇后的恳求下，高宗降旨屡加赐封。
身在宫中的杨牡丹，起居饮食、穿着日用由官府供应，平常有宫娥服侍，吃的是山珍海味，穿的是丝罗绸缎，出外乘坐奢华的车辆。莫说武家子侄，即是宫殿所有的人，包含皇上在内，对她都很尊敬。
显庆五年(660)三月，武后和唐高宗到并州武氏故土，设宴招待“从官及诸亲，并州官属父老”，“赐酤三日”，又“祠旧宅，从武士彟、殷开山、刘政会配食”。这是武则天第二次回故土，与20多年前不一样的是，这次是带着皇上女婿荣归故里，光宗耀祖。这一年杨牡丹已是82岁高龄的白叟了，但是，她精力健旺，和皇帝皇后同行，没有疲累的感受。她也是脱离文水后二十多年参拜老公的坟茔，举行了盛大的祭奠。
就在这年的十月，高宗得病，“风眩头重，目不能视”，便将朝廷政务交给武后代行，实质上算是把握了朝廷中的全部权利，由她一人决议计划，独行其是。自此以后武则天展露了她的政治才干，由于武则天生性蛮横，每逢有大事抉择，高宗都受制于武则天，高宗十分不满，所以在麟德元年（664年）与宰相上官仪协商，打算废掉武则天皇后之位。但上官仪的废后诏书还未草拟好，武则天即已接到音讯。她直接来到高宗面前，诘问此事，唐高宗不得已，便把职责推到上官仪身上。十二月，上官仪被拘捕入狱，不久，即被满门抄斩。从此以后，唐高宗每次上朝，武则天必在帘后操纵，全国大权完全归武后把握，乃至连生杀大事都由武后决议了，高宗只能唯唯从命，所以，朝廷表里都称为“二圣”。
