此后，朝鲜人又在全州为王士琦立碑，以感谢他从倭人手中拯救了自己的性命。然而王士琦却说：“我奉天子之名拯救贵国，绝非为了沽名钓誉、扬名外国，请将这座碑毁了吧！”然而朝鲜士民却“遮道而哭”“一再顾请”，最终石碑还是立了起来。
在王士琦等明朝英雄的主导下，强横的日本侵略者最终只能灰溜溜地逃回日本，丰臣秀吉也在忧惧中死去。至今，王士琦的英雄形象，仍在朝鲜和韩国广受称颂。1953年，当金日成访问中国时，还特意提了王士琦的名字。1990年，韩国使团来到中国，也称赞了王士琦对驱逐日寇的突出贡献。
1618年，王士琦因积劳成疾而去世。由于他为官清廉，深受人民爱戴，随葬唯裹身的草席而已。而临海县志也表示：“病故之日, 帑无长物,旅棣萧然。祀乡贤祠。”
很显然在此时，王士琦的坟墓内是没有埋入金银器物的。然而到了天启年间，朝廷追述王士琦的战功，认为他的葬礼级别太低，于是为他“天恩赐葬”，而如今王士琦墓中价值连城的金银器物，或许就是这个时候埋入的。作为抗倭英雄，王士琦配得起这样的随葬。
