然而，接下来的几年里，随着明代开始进行北方，势力范围逐渐扩展到了北方，最终将元代朝廷赶出北京，逃往草原。到了这个阶段，南京作为明代的首都，就开始出现问题了。南京距离北方边境实在太远，一旦北元代廷再次南下，南京这边便有些鞭长莫及的感觉。
所以，等到明代逐渐拿下整个中原，并且收复北京、山西、陕西等地之后，朱元璋就开始想到了迁都。
但问题是，迁到哪里?
对于当时的朱元璋来说，选择其实很多。西安、太原、北京、开封，甚至包括朱元璋的老家凤阳，都在朱元璋的考虑范围当中。这几个地方，可以说是各有利弊。凤阳是朱元璋的老家，是朱元璋的龙兴之地。古代人最讲究气数，所以凤阳在风水气运方面，深得优势。不过除此之外，凤阳就没有其他任何优势了，所以可能性最小。
除了凤阳之外，其他几个地方，则相对靠谱许多。北京、太原、西安、开封这几个地方，都相对更靠北方，更容易将来抵御北元。这其中，长安是秦汉隋唐的都城，意义重大;开封则是北宋的都城，同样不容小觑。至于北京和太原，则处在抵御北方游牧民族南下的关键地点，都有些天子守国门的意思。
到底要选哪里迁都，朱元璋其实也没想好。毕竟，这几个地方各有利弊。不过，朱元璋后来还是做了一些选择，除太子朱标之外，老朱其他几个年龄最长的儿子，被分别封到了这几个地方。老二就藩长安，老三就藩太原，老四就封北京，老五就封开封。
按照朱元璋的意思，是希望自己的几个儿子先去建设一下这几个地方。再过十年二十年之后，等到这几个地方都被建设得差不多，再进行比较，最终决定迁都哪里。十几年之后，这几个地方的建设逐渐完成之后，朱元璋开始越来越倾向于选择长安。
