然而遗憾的是，在这个局势动荡的乱世，刚直不阿，不畏强权的孔融，也就难以获得一个寿终正寝的结局。
在曹操和袁绍逐鹿中原的时候，孔融已经成为了北海太守，作为一方诸侯，在任六年，更是受到了军民百姓的爱戴，一直到196年，孔融因为受到袁谭军队的攻击，最终被迫逃到山东，之后来到许昌朝廷，被汉献帝征召为将作大匠。
在此期间，孔融也和曹操结怨，当听闻曹操进攻袁绍邺城，抢掠袁绍家女子，儿子曹丕更是将袁熙妻子甄姬占为己有，因此孔融专门写了一封信给曹操"武王伐纣，将妲己赏赐给周公。"对此曹操是一头雾水，不知何意，对此孔融却解释道："从如今来看，这种事情应该是想当然的。"（以今度之，想当然耳。）言下之意正是嘲讽了曹操不讲礼节的荒唐。
