萧氏不仅能照顾丈夫的生活起居，还能在事业上助丈夫一臂之力。杨广坐镇江南时，大力拉拢江南士族和佛教高僧，萧氏梁朝皇室的出身和佛教信仰的背景，为他加了不少分，提供了不少帮助。
杨广决定夺嫡时，萧氏也全力支持。他想与心腹郭衍商讨夺嫡大计，但怕两人无故来往惹人非议，便以晋王妃为郭衍的妻子治病为借口，才让郭衍夫妇能往来江都。每当独孤皇后派宫人来探视夫妻俩，萧氏就与宫人同吃同住，以此讨好皇后。
开皇二十年，杨广如愿被册封为太子，萧氏随之成为太子妃。仁寿四年，隋文帝驾崩，杨广登基，次年改元"大业"，册封三十九岁的萧氏为皇后。隋炀帝即位后，多有失德，实行暴政，萧皇后多次婉言劝谏，皆无果。杨广曾多次下江南，她都陪在其身边。可见她依旧深得隋炀帝的宠爱和敬重。
大业十四年，江都发生政变，杨广被叛军宇文化及等人杀死，萧皇后就带着皇室诸女，被叛军带到了聊城。宇文化及垂涎她的美色，萧皇后提出必须以帝王的礼仪安葬杨广，不然宁死不从。宇文化及满足了她的要求，称帝后封其为淑妃。
